A permanens marker tintát úgy tervezték, hogy ellenálljon a víznek és más gyakori oldószereknek, ezért csak vízzel nehéz eltávolítani. Az állandó markerekben található tinta úgy van kialakítva, hogy erősen tapadjon a felületekhez, és ellenálljon a fakulásnak vagy elkenődésnek, ezért gyakran használják olyan címkézésre vagy jelölésre, amelynek hosszú ideig kell tartania.
Vannak azonban olyan helyzetek, amikor a víz korlátozott hatással lehet a tartós jelölőfestékre. Például, ha a tinta viszonylag friss, és még nem kötött meg teljesen, egy nedves ruhával vagy szivaccsal esetleg letörölheti a tinta egy részét. Ezenkívül, ha a megjelölt felület porózus vagy nedvszívó, a víz elősegítheti a tinta hígítását és szétterítését, ezáltal kevésbé látható.
Általában azonban a víz nem hatékony módszer a permanens jelölőtinta eltávolítására. Ehelyett általában speciálisabb tisztítóoldatokra vagy oldószerekre van szükség a tinta hatékony eltávolításához. Ezek a megoldások tartalmazhatnak alkoholt, fehérítőt (fehér textíliákhoz), speciális tisztítószereket vagy egyéb vegyi anyagokat, amelyek képesek lerontani a tinta tapadó tulajdonságait.
Amikor megpróbálja eltávolítani a tartós jelölőfestéket, fontos figyelembe venni a kezelt felületet, és olyan tisztítási módszert választani, amely biztonságos és hatékony az adott felületen. Mindig célszerű először egy kis, nem feltűnő területet tesztelni, hogy a tisztítóoldat ne okozzon sérülést vagy elszíneződést.